Detección de SARS-CoV-2 en superficies

Detección de SARS-CoV-2 en superficies



En el post anterior, presentamos la línea de productos GeneCount® de LuminUltra. Una gama de kits de análisis rápidos mediante la técnica PCR para la identificación genética microbiana, como método rápido, preciso e in situ. Hoy en MicroPlanet dedicamos un post al kit específico para la detección de SARS-CoV-2 en superficies, perteneciente a la gama GeneCount®. Sabemos que la prevención es la mejor manera de evitar el contagio y controlar el desarrollo de la pandemia. Por eso es sumamente importante la desinfección de espacios públicos y edificios en general. Este nuevo kit de LuminUltra permite el control específico de la correcta higienización de estas superficies. 

El SARS-Cov-2 en superficies

El virus SARS-CoV-2 se transmite principalmente mediante gotas de secreciones bucales y nasales, pequeñas partículas aerosoles y por el contacto directo. Podemos contagiarnos con facilidad si no tomamos las medidas de precaución necesarias. Especialmente en espacios comunes donde la interacción entre personas y de personas con el medio es mayor. En este sentido, la monitorización medioambiental resulta una herramienta fundamental en la prevención y disminución de los contagios.

Industrias, medios de transporte, infraestructuras sanitarias, espacios públicos..., son potenciales zonas de infección con alto riesgo y origen de rebrotes importantes. Desde el punto de vista higiénico debemos aplicar los medios necesarios para evitar la trasmisión del virus.

Las superficies en general reciben las gotas infectadas y se convierten en zonas contaminadas donde el virus permanece. El virus se mantendrá activo más o menos tiempo según el tipo de superficie. En superficies de cobre sólo prevalece 4 horas, en plástico el virus se mantiene hasta 72 horas y en madera o vidrio permanece de 1 a 2 días como promedio. Esto indica que para evitar focos de contagio es esencial la correcta desinfección de las superficies.

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Sin embargo, no basta con desinfectar, se debe comprobar que la desinfección se ha hecho correctamente y ha sido efectiva. Existe una lista actualizada de productos adecuados por su efectividad virucida. Pero no sólo es necesario utilizar productos homologados sino que se debe comprobar que el resultado es el que se pretende. De esta forma, la detección directa de SARS-CoV-2 en superficies resulta clave para verificar el tratamiento realizado y evitar la propagación del coronavirus.

GeneCount®, análisis rápidos, fiables y precisos

Como forma de detección directa de la presencia de SARS-CoV-2 ya hemos oído hablar de la técnica de la PCR (qPCR, quantitative Polimerase Chain Reaction o Reacción Cuantitativa en Cadena de la Polimerasa) ampliamente utilizada para diagnóstico clínico de enfermedades víricas y bacterianas. 

Nuestra representada LuminUltra ha logrado mantener los principios de portabilidad, sencillez y precisión de sus productos ATP2G también en la nueva línea GeneCount® para biología molecular. La tecnología propia desarrollada para GeneCount® se basa en la técnica de la qPCR para poder identificar y cuantificar microorganismos de forma específica en diferentes tipos de matrices. En 2 horas y sin necesidad de disponer de un laboratorio de PCR tradicional se puede identificar E. coli, Legionella sp, Legionella pneumophila, Pseudomonas, aerobios totales, bacterias nitrificantes y SARS-Cov-2, entre otros.

Las soluciones completas de LuminUltra incluyen:

  • Productos para la toma y la preservación de la muestra
  • Productos para la purificación de ADN/ARN 
  • Productos para el análisis mediante qPCR 

Gene Count® qPCR para la detección de SARS-CoV-2 en superficies

Debido a la rapidez con la que avanza la pandemia y a la urgencia en la detección del virus en superficies potencialmente contaminadas, se están utilizando actualmente kits de qPCR de tipo clínico para este fin. En la mayoría de casos el protocolo de toma de muestra y análisis es el mismo y, sólo en algún caso, se adaptan para la identificación del SARS-CoV-2 en superficies. Si bien estos análisis cumplen con su objetivo, detectar la presencia del virus, la validez del diagnóstico se ve comprometida por la falta de rigor en el aislamiento del ARN problema.

Como sabemos, el diagnóstico clínico de la Covid-19 se realiza mediante el análisis de muestras nasofaríngeas y no en otro tipo de muestra biológica. Los kits para análisis clínicos especifican en las instrucciones del producto su uso para este tipo de muestras. No obstante, las condiciones en las que se desarrolla el virus en el cuerpo humano no son las mismas que se encontrará en el medio ambiente. Entonces, ¿por qué un kit qPCR dirigido al diagnóstico clínico funcionaría con muestras ambientales?

Tener en cuenta este factor a la hora de seleccionar el kit que vamos a utilizar en nuestro análisis es fundamental: la toma de muestra, la extracción o purificación de ARN y el análisis final, deben formar un conjunto diseñado para este propósito. La clave de todo diagnóstico preciso y fiable en qPCR no sólo está en la efectividad de la extracción del material genético, sino también en recuperar el total de ARN en el muestreo y preservarlo hasta el momento de la purificación (extracción) y separación del resto de componentes de la muestra.

Esta extracción correcta se debe realizar, dependiendo de la matriz origen, de una forma u otra para purificar todo el ARN posible. Por muy eficaz que sea el sistema de amplificación y el sistema de lectura posterior no servirá de mucho si no hemos conseguido recuperar previamente el máximo de ARN de la muestra origen. 

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La línea de productos GeneCount® incluye nuevos kits de qPCR para detección de SARS-CoV-2 denominados SARS-CoV-2-ENVIRON, donde se incluye el kit específico para superficies, SARS-Cov2-SURF. La experiencia adquirida por LuminUltra como fabricante de kits PCR para la detección de la COVID-19 en el ámbito clínico ha servido para desarrollar nuevos kits específicos para su uso con otras matrices (superficies, aguas residuales...), muy diferentes a los análisis nasofaríngeos.

Tras meses de intenso trabajo se ha conseguido presentar en el mercado un test eficiente para este diagnóstico, con protocolos diferenciales en la toma y preservación de la muestra, la purificación de ARN y el análisis qPCR para procesar muestras tomadas en superficies. Estos protocolos están optimizados para su uso en conjunto (el protocolo engloba la toma de muestra, preservación, extracción y análisis) y garantizan resultados precisos, con una alta sensibilidad y especificidad contrastadas.

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Debemos tener en cuenta que el virus cohabita en las superficies, supuestamente, con residuos orgánicos e inorgánicos, incluyendo restos de desinfectantes. Es una matriz muy diferente de la nasofaríngea, razón por la cual se debe garantizar una toma de muestra precisa y una purificación de ARN efectiva. Así podremos garantizar una máxima especificidad y sensibilidad para el análisis.

El muestreo con GeneCount® SARS-CoV-2-SURF

Como ya hemos señalado, la fiabilidad del resultado analítico depende de varios factores. La toma de muestra es el primer paso del proceso y muy importante para el correcto análisis y diagnóstico.Se debe realizar correctamente y a su vez garantizar la perfecta preservación de la muestra con el fin determinado, para su envío al laboratorio. Con el pack de toma de muestra y preservación GeneCount® Surface RNA SAMPLE PRESERVATION incluido en el kit (específicamente desarrollado para superficies por LuminUltra y del cual tiene la propiedad intelectual) se consigue:

  1. La inactivación inmediata del virus tras la toma de muestra.
  2. La estabilización del ARN, con la neutralización de enzimas y proteínas que puedan existir en el medio.
  3. La preservación del material genético, ante la presencia de residuos propios de la superficie (restos de detergente o desinfectantes, por ejemplo) que puedan alterar la integridad del ARN.

Con SARS-CoV-2-SURF una vez se ha tomado la muestra permanece estable a temperatura ambiente durante 5 días. Así, es posible transportar la muestra sin necesidad de refrigeración y de una forma más económica. Esto nos permite tanto la posibilidad de enviarlo a un laboratorio externo para su análisis o bien hacer el análisis qPCR in situ (en planta, por ejemplo). Este paso de preservación es crítico porque la posible degradación de los ácidos nucleicos en esta primera fase puede alterar los resultados analíticos en forma de falsos negativos.

A la hora de hacer la purificación del ARN, el protocolo de LuminUltra nos asegura una máxima presencia del ARN en condiciones óptimas para su extracción (recuperación) y posterior análisis. Esto resulta fundamental en muestras de superficies donde la carga viral suele ser baja (en comparación con muestras nasofaríngeas). La optimización del protocolo en la toma de muestra y preservación garantiza la recuperación máxima de ARN para un resultado fiable y con elevada sensibilidad.

Por último, el ARN aislado a partir de muestras de superficies se prepara para su análisis con el pack GeneCount® SARS-CoV-2 RT-qPCR SCREENING también incluido en el kit. Se obtienen resultados fiables y precisos. En el caso del análisis, LuminUltra nos ofrece total portabilidad para el usuario con los equipos termocicladores portátiles GeneCount® Q8 y Q16 para realizar la qPCR en cualquier lugar. Es decir, in situ: en la propia planta de producción, en los talleres de desinfección de metro y ferrocarril, en el aeropuerto, en zonas de uso común, espacios públicos y, por supuesto, en laboratorio de calidad de una industria alimentaria.

Opciones disponibles de GeneCount® SARS-CoV-2-SURF

A diferencia de los protocolos tradicionales de qPCR, con el uso de los kits SARS-CoV-2-SURF, no es necesaria la separación de zonas propia de un laboratorio de PCR. Principalmente porque la purificación de ARN se hace de forma fácil y sencilla, minimizando el riesgo de contaminación cruzada.

GeneCount® SARS-CoV-2-SURF se ofrece en 3 formatos diferentes según los requerimientos analíticos que necesite, siempre con la máxima especificidad y sensibilidad, asegurando la fiabilidad y robustez de los resultados. Consúltenos para poder ofrecerle el mejor producto para sus propósitos. Además, la sencillez de sus protocolos no requiere que los usuarios tengan experiencia específica en analítica de PCR tradicional. Razón por las cual pueden realizarse los análisis in situ. Estos productos ofrecen soluciones concretas para las necesidades actuales en la detección del virus en superficies de cualquier tipo.

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Ventajas de uso de GeneCount® SARS-CoV-2-SURF para validar protocolos de limpieza y desinfección de superficies

Existen muchas razones para implementar SARS-CoV-2-SURF en su programa de higiene, entre ellas destacaremos:

  • La especificidad: estos ensayos no son adaptaciones de otros protocolos, han sido diseñados específicamente para la toma de muestras en superficies y su preservación, la purificación de este ARN presente en esta muestras superficial y su posterior análisis qPCR. Una solución completa y un protocolo único y optimizado.
  • Permite implementar un sistema de alertas tempranas, acorde con HACCP, e identificar áreas donde el personal estuvo expuesto al virus. De esta manera se facilita realizar labores de rastreo y pruebas clínicas pertinentes.
  • Detecta individuos asintomáticos o posibles rebrotes (por ejemplo, muestreando las mascarillas usadas por el personal).
  • Aumenta la confianza de empleados, clientes y visitantes en un ambiente seguro.
  • Disminuye riesgos, evita pérdidas por cierres parciales o completos y confinamiento de burbujas de individuos.

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En MicroPlanet seguimos trabajando para ayudarle a mejorar la calidad y productividad en su trabajo. Por eso le ofrecemos soluciones completas que le permiten monitorizar el SARS-CoV-2 en superficies y garantizar espacios seguros y saludables. Contáctenos y le ayudaremos a implementar el uso de los kits Gene Count® qPCR para la detección de SARS-CoV-2 en superficies, como método de autovalidación de sus protocolos de limpieza y desinfección. ¡Hasta pronto!

 

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